Genómica comparativa

Existen varios métodos para comparar genomas completos, aquí usaremos las utilidades creadas por el grupo del Dr. Dave Ussery llamadas CMG Biotools, también existe un wiki sobre estas utilerías. La mejor forma de realizar estas rutinas es siguiendo las instrucciones presentadas en el manual de CMG 2.2 (ver abajo para descargarlo).

Temas

1. Obtención de genomas
2. Manejo de datos
3. Comparación de genomas procariontes con
   1. CMG Biotools. Genome atlas
   2. MAUVE
   3. ACT
4. Comparación de proteomas
5. Core y pan genome
6. Creación de árboles filogenéticos
7. Visualización de genomas
8. Fenotipos de genomas

El flujo de trabajo de CMG se presenta a continuación: