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Genómica
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2. Ensamble de genomas
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3. Scaffold
4. Sintonía de genomas
5. Anotación de genomas
6. Visualización de genomas
7. Identificación genomas
Genómica comparativa
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Pan / Core genome
CBS Pan-core plot
Pancore subsets
Panseq
Pangenoma anvio7
Proteomas
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Metagenómica 16S/18S
1. Metadatos
2. Descontaminación
3.1 Quimeras
3.2 Descontaminación
3.3 Dominios
3.4 Eucariontes
3. Clasificación
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Comparación regiones
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Microbioma
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QIIME
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QIIME 1.5
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RDP
4. Diversidad
5. Visualización
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FigSankey
Krona
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6. Análisis estadísticos
Paso a paso
Pipeline viejo
Metagenómica shotgun
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Visualización
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Bioinformática microbiana
Pan / Core genome
La obtención del pangenoma o el genoma núcleo (core genome) la podemos obtener con varios programas:
CBS pan core genome plot
Panseq
Pangenomas y filogenómica con Anvi'o
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