Taxonomía y filogenia

Análisis bioinformáticos para comparar secuencias o genomas con fines taxonómicos.

• Filogenia con uno o pocos genes

  • 16S rRNA

  • MultiLocus Sequence Analysis (MLSA)

• Taxonomía genómica

  • Identificación de genomas

  • Average Nucleotide Identity (ANI)

  • Genome to Genome Distance Calculator (GGDC)

  • Filogenómica (Anvi'o)

Análisis generales

• Alineamiento

• GBlocks

• Arboles filogenéticos

• Obtención de genomas