3.3 Dominios

Una tercer tratamiento de descontaminación que se puede realizar a las secuencias es separarlas por dominios (bacteria, archeae y eukarya). Para esto podemos correr un script de QIIME que realiza este proceso y genera archivos separados.

Este script se realiza una vez que se han corrido los scripts de QIIME.

$ split_otu_table_by_taxonomy.py -i otu_table.biom -L 2 -o split_otu_tables/